3 多个相同平台芯片原始数据RMA标准化后转换探针生成的表达矩阵无法应用boxplot绘图是怎么回事?

将4个同一平台先RMA标化后转换探针生成txt,用boxplot 绘制箱线图为何只有导出的txt ,没有图等pdf呢?看了一些帖子说Y值内不能有空格,好像没有空格,但是有很多///,是因为这个问题吗?刚才加载了violot包,也还是出不来图片

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3 个回答

liuzhe

请把你的boxplot绘图代码黏贴一下

另外:我看到你的A///B的意思是基因名字或者叫作A,或者叫作B,这个不影响的,你可以只取基因A,然后表达值用后面的数值即可

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杨懿

请问问题解决了吗,我也出现这样的情况

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好好学习

这个问题,我在不同电脑安装的时候,也发现了,具体原因,与R语言包调用有关。

解决办法,打开R.exe

>install.packages("vioplot")

>install.packages("ggplot2") #这个也顺便装上把,以后画气泡图用的到。

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  • XIAOFEI LIU 提出于 2019-01-24 14:09

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