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2018-08-23 09:16 回答问题

 GSEA是通盘考虑全部差异基因的作用,即使某个基因p值只有0.049,gsea也会考虑。go和kegg富集时,优先考虑p值显著的,对于p值0.0499的,程序会默认他们不重要。

2018-08-23 09:16 回答问题

1、尝试升级下R版本;2、用biocLite重新安装WGCNA包。

2018-07-24 08:02 回答问题

这个是常见的情况,软阈值超过一定阈值之后不再符合冥分布,如果觉得看着不舒服,可以把13之后的部分给截掉,1:12,软阈值选择6就可以了

2018-07-24 08:00 回答问题

这种情况 都是 没有安装好 java的原因,在升级 界面里配置一下java

2018-07-24 08:00 回答问题

没有表头 你需要在软件的右侧勾选 包含表头 这样就能导出表头了

2018-07-24 07:58 回答问题

所以你想用WGCNA做什么呢?根据你的思路去选取 数据处理方法

2018-07-24 07:57 回答问题

应该是你安装的那个java版本的问题,可以使用内置的java看看

2018-07-24 07:55 回答问题

这种情况 建议你先做一下TPM,或者分位数标准化,如果还是这样 说明结果本身就是如此

2018-07-23 17:47 回答问题

这些 使用Excel配合小工具 就可以完成

2018-07-23 08:48 回答问题

看你的文件名称 很奇怪,这样的文件名称路径可能不识别,建议你换个正常点的文件名称