GEO数据挖掘之火山图和热图绘制

那么数据预处理、数据标准化都已搞定,接下来进入数据分析阶段,那么本节主要怎么通过sangerbox中的DEcenter进行差异分析、根据差异分析结果使用火山图工具以及热图绘制工具。 1、首先让我们看...

那么数据预处理、数据标准化都已搞定,接下来进入数据分析阶段,那么本节主要怎么通过sangerbox中的DEcenter进行差异分析、根据差异分析结果使用火山图工具以及热图绘制工具。

1、首先让我们看下分析目录,怎么制作分组文件、拿到分组文件后DEcenter的使用操作、根据差异分析结果进行火山图

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2、表达谱数据和分组信息准备,为差异分析做准备

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3、DEcenter使用视频,里面包括limma、T检验、秩和检验、DESeq2、edgR等等应有尽有,以及差异结果解读哦

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4、火山图绘制工具使用说明,以及结果调整。

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5、那么重头戏来了,热图绘制,怎么画才能好看呢,还是一堵是怎么搭配小工具做出完美热图的

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6、最后一张完美图是怎么得到的

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  • 发表于 2018-06-15 15:50
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