小白福音:TCGA突变瀑布图简易个性化绘制工具

突变相关分析的时候我们经常会选择瀑布图进行展示,瀑布图看起来十分的复杂高端,TCGA数据库中提供了近30种肿瘤的外显子测序数据,在这里我们开发了一个 个性化的工具 可以快速的展示指定基因在...

突变相关分析的时候我们经常会选择瀑布图进行展示,瀑布图看起来十分的复杂高端,TCGA数据库中提供了近30种肿瘤的外显子测序数据,在这里我们开发了一个 个性化的工具 可以快速的展示指定基因在指定样本中的突变景观。

需求1、绘制某个肿瘤中的突变频次最高的前X个基因的突变景观

attachments-2021-10-83v75Jbr6176294fda510.png点击提交之后 展示图形:

attachments-2021-10-DuYacHpA617629d36cb40.png

需求2:指定绘制某些样本的突变频次最多的前X个基因的突变景观

attachments-2021-10-XkrQYeyG61762a5fe0298.png

点击提交:

attachments-2021-10-9ehbzFsF61762ab8ab47e.png

需求3:指定某些基因在某些特定的样本中的突变景观

attachments-2021-10-mxebWxXh61762b0b2ab88.png点击提交:

attachments-2021-10-1rVxZTHE61762b31a65eb.png需求4:指定某些基因在某些特定的样本中的突变景观,并将这些基因进行分组

attachments-2021-10-mUd9vDvu61762b80c690a.png可视化如下:

attachments-2021-10-b1tOJWZB61762ba863baa.png需求5:指定某些基因在某些特定的样本中的突变景观,并将这些基因进行分组,并统计他们在不同样本组中的突变差异

attachments-2021-10-PSOhUz9f61762be946a6a.png可视化如下:

attachments-2021-10-GVBua8mx61762c3337c69.png需求6:不仅仅有分组,还想对 基因或者样本进行 更多的注释

attachments-2021-10-cMO9VuCz61762c8a85f6c.png

可视化如下:

attachments-2021-10-dDS2bf3Y61762cbdec7bd.png需求8:当我们仅仅只想对 样本或者 基因进行分组,然后又想带多个注释信息,此时 我们可以将 分组列设成 只有一个值,这样就可以过滤掉分组了

attachments-2021-10-twtBlAfr61762d280c0ea.png可视化如下:

attachments-2021-10-19zTG3kn61762d442d5b2.png

最后,在网页下方有绘图的描述:

attachments-2021-10-CJOikGxw61762d5aac001.png





  • 发表于 2021-10-25 12:07
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  • 分类:软件工具

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