PCA、Umap和tSNE分析可视化工具

PCA、UMAP、tSNE是常见的几种降维方法,具体原理可以参考:常见的PCA、tSNE、UMAP降维及聚类基本原理及代码实例 在这里我们开发了一个简易的PCA、tSNE、UMAP的一键化工具,用来快速的做PCA、tS...

PCA、UMAP、tSNE是常见的几种降维方法,具体原理可以参考:常见的PCA、tSNE、UMAP降维及聚类基本原理及代码实例

在这里我们开发了一个简易的PCA、tSNE、UMAP的一键化工具,用来快速的做PCA、tSNE、UMAP分析,输入界面如下:

attachments-2021-08-OUXN8nHL61249d6a696c6.png输入一个表达矩阵就可以了,样本分组这个信息是用来画图的颜色标记的

点击按钮-》开始分析-》输入 任务名称

attachments-2021-08-XwtDaMMh6124a054c3404.png

点击确定后,等待任务完成

attachments-2021-08-s3r1Bi2R6124a0c852d4d.png载入结果后 可以对结果进行调整,如下:

attachments-2021-08-dGrFicil6124a1563922d.png

此外 还有运行日志和写作指导:

attachments-2021-08-2JSTDQXh6124a401c93b1.png

attachments-2021-08-Crq5CJGm6124a40db1b5d.png

几种主要的图片展示如下:

attachments-2021-08-dqqhtknR6124a434568a0.pngattachments-2021-08-ZFDweZcs6124a43fc8e44.png

attachments-2021-08-z5lyeBP66124a450b5d02.png



  • 发表于 2021-08-24 15:49
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  • 分类:软件工具

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